Llaitul fue detenido el 28 de abril de 1988, cuando era estudiante universitario, y recluido en la cárcel de Quillota, donde permaneció incomunicado durante 10 días y sufrió crímenes de lesa humanidad por parte de la disuelta Central Nacional de Informaciones, la policía secreta del régimen.
Por este hecho, el Estado chileno deberá indemnizar al dirigente mapuche con 12 millones de pesos (12 mil 500 dólares).
Llaitul, actual líder de la Coordinadora Arauco Malleco, se encuentra en prisión preventiva desde el 25 de agosto, acusado por diversos delitos contra la seguridad del Estado.
Según el Ministerio Público, el comunero participó en el hurto de madera, usurpación e incitación a la destrucción de instalaciones privadas, sin embargo, para su abogado, Rodrigo Román, Llaitul es perseguido por sus ideas.
